Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA10P31260 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA10P31260 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms