Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPREP23469 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPREP23469 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPREP23469 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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