Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ERCC2P18074 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ERCC2P18074 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC2P18074 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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