Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2RAP15509 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms