Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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