Protein–RNA interactions for Protein: O94844

RHOBTB1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB1O94844 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBTB1O94844 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms