Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms