Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms