Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms