Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARHGEF10O15013 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARHGEF10O15013 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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