Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms