Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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