Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms