Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF879B4DU55 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF879B4DU55 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF879B4DU55 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF879B4DU55 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF879B4DU55 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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