Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
A4D1N5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
A4D1N5 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
A4D1N5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms