Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms