Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRG3Q9Y2Y8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms