Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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RNF7Q9UBF6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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