Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms