Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP35Q9P2H5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms