Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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