Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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