Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms