Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRNAU1APQ9NX07 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms