Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms