Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms