Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms