Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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