Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCO2Q9BYV7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms