Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms