Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms