Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms