Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms