Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SPOCK3Q9BQ16 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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