Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRPF18Q99633 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRPF18Q99633 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRPF18Q99633 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRPF18Q99633 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRPF18Q99633 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPF18Q99633 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms