Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms