Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CPNE2Q96FN4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CPNE2Q96FN4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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