Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms