Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q7L0L9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms