Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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