Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPRC1Q5VV67 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms