Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCAF6Q58WW2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCAF6Q58WW2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms