Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM187BQ17R55 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms