Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PCK2Q16822 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms