Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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