Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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