Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms