Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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