Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms