Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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